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自私的基因讀書筆記
讀書筆記是指讀書時為了把自己的讀書心得記錄下來或為了把文中的精彩部分整理出來而做的筆記。在讀書時，寫讀書筆記是訓練閱讀的好方法。
自私的基因讀書筆記一：
自私的基因基本論點
人類和其他物種都是各自的基因所創造的生存機器或者叫生存載體，進化的關鍵在于基因的利益�；蛲ㄟ^自己編寫的程序控制著生命體的行為以達到自己的利益，一個成功的基因突出的特點就是其無情的自私性。
我最喜歡的一個章節：作者的原始湯比喻
30-40億年前生命誕生初期的海洋就如同一個原始湯，里面包含一些簡單的化合物：水，二氧化碳，甲烷和氨。有機物質在某些地方聚積起來，在受到紫外線之類的能量影響后結合成更大一些的分子，由于沒有細菌，這些有機分子可以存在很久。于是大量的有機物質就形成了濃稠的原始湯。
某一時刻一個分子突然獲得了復制自己的特性，隨著復制錯誤的產生和擴散，原始湯中的有了差異化的復制分子種群。更加穩定的分子壽命更長，并且有更長的時間去復制自己，于是形成了一個進化趨勢。這些分子是不是有生命的?作者的解釋是詞匯僅僅是供我們使用的工具，有生命的是人類為了理解世界而進行的一種分類。因此是否是有生命的定義并不影響它的存在和演化等客觀事實。
待原始湯中的自由有機分子降低到一定比例，復制分子的競爭開始了，那些變異出能夠分裂其他品種的復制分子形成了進化趨勢，隨之而來的是那些變異出能夠將自己裹在一層蛋白質中以保護自己的進化趨勢，這也許就是第一批細胞的成長過程。
隨著時間的推移，復制分子為了保證自己在世界上得以存在下去而采用的技巧逐漸改進，用以改良的時間幾乎是無窮無盡的。經過40億年古代的復制分子又變成什么樣子了呢?
今天，別以為它們還會浮游于海洋之中。很久以前，它們已經放棄了這種自由自在的生活方式了。在今天，它們群集相處，安穩的寄居在龐大的步履蹣跚的機器人體內，與外界隔開來，通過迂回曲折的間接途徑與外部世界聯系，并通過遙控操縱外部世界。它存在于你和我的軀體內，它們創造了我們，創造了我們的肉體和心靈，而保存它們的真是我們存在的終極理由。這些復制分子源遠流長，今天我們稱之為基因，我們就是它們的生存機器。
自然選擇的顆粒度(最小單位)是基因
任何一個個體不過是壽命不長的基因組合體的臨時運載工具，而基因卻能夠生存很久。基因不會衰老，它一代一代的從一個個體轉到另一個個體，用它自己的方式，為了它自己的目的，操縱著一個又一個的個體，它在一代接一代的個體陷入衰老死亡之前拋棄這些將要死亡的個體。
每個個體都是獨特的，也就是說僅有一份拷貝，因此在實體之間進行選擇是不能實現進化的。你的子女自由一半是你，你的孫子孫女自由1/4是你，經過若干代，你的獨特特性在你的后人中只有極小的一部分，即使他們還姓你的姓。
成功的基因并不一定是強大的基因，而僅僅是在群居協作條件下比其他對位基因能更好的操縱生命體去生存和繁衍基因。作者使用了說德語的劃船手和說英語的劃船手在教練心目中的能力作為比喻。
生存機器與機器人
生命體都是有目的性的，但是有目的性的卻不一定是生命體，例如各種被委以使命的機器人。基因也控制著它們所屬的生存機器的行為，但不是像鋼鐵人那樣人為操作，而是像給無人操作的機器人編寫程序那樣間接操控。因為時滯原因，它們只能事先部署，事后生存機器在獨立操作時它們只能袖手旁觀。作者用了《仙女座的A》中的故事來比喻：離我們200光年之遙的仙女座里又一個文明世界，那里的人們想把他們的文化傳播到遠方的世界去，但是，一切通信都需要太長的時間，等待對方的回應并保持通信是沒有實際意義的。因此，他們寫了一份長篇電文，指導別人如何建造一臺巨型計算機并為它編制程序。人類截獲了電文并按照指示建立了巨型計算機，然而仙女座人實際上是想利用這樣的巨型計算機進行殖民統治，這臺計算機幾乎把整個世界至于它的獨裁之下。仙女座人并沒有直接操縱地球上的事務，而是用這樣一臺計算機來達到他們的目的，正如我們的基因為我們建立了一個大腦一樣。
基因預測到，吃糖和交配可能對自己的生存有利，因此告訴了大腦口中的甜味以及情欲亢進是有益的。但基因卻不能預見到糖精和自慰也可能為它們帶來滿足。它們也沒有能適應，在物資充裕的現代糖吃的過多的危害。
一些有趣的觀點
基因庫中在生命周期晚期活動的致死基因比早期活動的致死基因穩定，因為年紀較大的個體如果至少經過若干次生殖之后，致死基因的作用才表現出來，那么它依然可以遺傳給無數后代。因此，如果可以想辦法讓基因認為它所寄居的個體比實際的要年輕那么就可以延長人的壽命。
無性生殖和一般生長無任何區別，二者都是簡單的有絲分裂，因此整片榆樹林可以認為是一個單一的個體。
自私的基因讀書筆記二：
蟻群效應
螞蟻、蜜蜂、白蟻的種群通過化學信號來互通情報，整個集體行動起來好像是一個單位，具備自己的神經系統和感覺器官。KK的《失控》一書中把這種昆蟲群體的集體行動稱為“涌現”。
在群居昆蟲的群落里，大多數個體是不育的職蟲。不朽的基因連續線只貫穿在少數有生殖能力的個體之內，它們和我們精巢和卵巢里的生殖細胞相似。而不育的職蟲和我們的肝臟，肌肉和神經細胞相似。
一個群居昆蟲的群落就是一個大家庭，其所有成員通常都為一母所生。有生殖能力的雌蟲叫女王，它們不干其他任何事情，依靠職蟲為它提供食物和保護。職蟲從不繁殖，一般分為若干明顯的等級，包括兵蟲，大職蟲，小職蟲以及一些高度專業化的等級如“蜜罐蟻”。
蜜罐蟻的蟻群中，有一種工蟻不做其他工作，整天吊在巢頂上一動不動。它們腹部裝滿了食物，大的像電燈泡，其他工蟻把它們當作食品庫。它們不再是作為個體而存在，而是為了集體的利益抑制自己的利益。
一只正常動物的軀體之所以受到操縱就是為了要生育后代以及撫養擁有同樣基因的其他個體，以保證基因得以生存下去。只要我們接受了職蟲都不能生育這個事實，它們的自殺行為以及其他形式的利他性或合作性行為就不那么驚訝了。自殺性的自我犧牲行為很少進化——工蜂從不生育自己的后代。它們全部的精力都用于照顧不屬于自己后代的親屬從而保存自己的基因。一只不育的工蜂的死亡對它自身基因的印象，宛如秋天一顆樹落下的一片樹葉對樹的基因的影響。
一個與此相反的觀點是，職蟲“耕耘”有生殖能力的雌蟲，驅使雌蟲提高繁殖能力以復制職蟲的基因。女王制造出來的不是職蟲的后臺，但它們都是職蟲的近親。有實驗證明，為女王提供食物和保護的職蟲其實可以出于其自身的利益(傳遞更多與自己相同的基因)而實際上操縱一切。
覓母——文化基因
秦始皇不能夠和一個現代中國人交談，盡管我們和他之間大約“僅”有100代，而每一代人都能和其上一代或下一代人交談。語言是通過非遺傳途徑“進化”的，而且速率比遺傳進化快幾個數量級。
文化不是人類所獨有，實驗證明黑背鷗的歌唱曲目也是通過非遺傳途徑進化的。
當你把一個有生命力的覓母移植到我的思想中時，事實上我的大腦就變成了這個覓母的宿主，使之成為傳播這個覓母的工具，就像病毒寄生于一個宿主細胞的遺傳機制一樣。
我們的基因可能是不朽的，但體現在我們每一個人身上的基因集體遲早要消亡。伊麗莎白二世是英王威廉一世的直系后裔。然而在她身上非�？赡苷也坏揭粋�來自老國王的基因。我們不應該指望生殖能帶來永恒。但如果你能為世界文明作出貢獻，如果你有一個精辟的見解或作了一個曲子、發明了一個火花塞、寫了一首詩，及時你的基因在共有的基因庫里全部分解后，這些東西(覓母)仍能長久存在，永不湮滅。
基因的延伸
基因作用于行為學：石蠶蛾的基因決定了它將造出哪種形狀的房子。
寄生生物的基因也可以間接作用于寄主，而關鍵點是寄生生物將基因傳遞給后代的方式是否和宿主的基因相同。如果相同，寄生生物與寄主的目標一致：是幫助其宿主生存并繁殖。隨著演化進行，它將不再是一個寄生生物，而將與宿主合作，甚至最終融入宿主組織，完全無法辨認其原為寄生蟲。我們實際上是所有古代寄生生物合成的遺物。更甚一步，如果寄生生物與宿主的基因共享一個離開方式：進入宿主的生殖細胞。這時哪些是宿主基因，哪些是寄生基因已經無關緊要了，因為生殖細胞是它們共同抵達未來的方式。
當我們感冒咳嗽時，我們通常認為這些癥狀是病毒行為的副作用。但某些情況下，它們更可能是病毒精心策劃的方法，以幫助其尋得下一個宿主。
瓶頸生命循環
想象兩種虛擬的海藻：瓶藻和散藻。
散藻有雜亂無章的枝葉，這些枝葉時不時斷落并漂浮而去。這種斷落可以發生在支部任何部位，碎片可大可小。散藻的枝葉可以像斷枝的正常植物一樣重新成長，掉落的部位其實是一種繁殖的方法。
瓶藻的繁殖方式是釋放單細胞孢子，由其在海里漂浮離去并成長為新的植物。這些孢子只是植物的細胞，和其他植物細胞沒有區別。瓶藻沒有性生活，子女所含的細胞只是父母植物細胞的克隆。
這兩種海藻唯一的不同是：從散藻處獨立的生物有許多細胞，而瓶藻釋放的永遠是單細胞。
這兩種植物讓我們看到瓶頸生命循環和非瓶頸生命循環的根本不同。瓶藻的每一個后代都是通過擠壓自己，經過單細胞瓶頸繁殖而成。散藻則在生長之后分為兩截，很難說是傳遞單獨的后代還是其已包含許多單獨的生物。
可以看到，散藻的繁殖與生長方式是相同的，事實上它基本不繁殖。而瓶藻則在生長和繁殖之間劃分了清洗的界限。
瓶頸般的生命循環的重要性在于它使回到最初的原點稱為可能。
結尾
即使在今天，不是所有基因的表現型作用都只限制在其所在的個體生物內。理論上，也在實際中，基因跨越個體生物的界限，操縱體外世界的物體，包括無生命的事物，有生命的生物體，遙遠距離外的事物。我們只需要一點想象力，就可以看見基因端坐于延伸表現放射網的中心位置。世界上任何一個物體都處于這張影響力網中的節點，這些影響力來自許多生物體內的許多基因�；虻挠|及范圍沒有明顯的界限。整個世界是一個十字，是有狙擊的基因指向表現型作用的因果箭頭，或遠或近。
物理學的時間箭頭是是熵增加的方向，曾有科學家定義生命為：可以減少熵的事物。那么，從這個意義上，也可以這么說，宇宙的物理學定律與基因共同塑造了我們今天的世界。
注：本書作者自始至終強調不能把基因看做是自覺地有目的的行為者，但是，盲目的自然選擇使它們的行為好像是帶有目的性的。凡是存在有性生殖的地方，每一個基因都同它的等位基因進行競爭，這些等位基因就是它們爭奪染色體上同一位置的對手。
自私的基因讀書筆記三：
我們從何處來?將要到哪里去?
在達爾文之前的人類，都覺得自己是神的子孫，或者是跟神有某種關系，然后達爾文橫空出世，拿著一堆動物的骸骨和化石，對狂妄自大的人類說：別做夢了，咱們不過是猴子的親戚而已，咱們的老祖宗包括地球上一切卑賤的生物，咱們也終將被更高級的生物所代替。
達爾文的這些話即使是在今天看來，也是很難接受的，看看日本人就知道了，讓他們承認自己的爺爺輩曾經干過傷天害理的事情都那么難，更何況承認自己是豬狗的后代呢?
不過《自私的基因》的作者又給我們提供了另一條思路，當然作者自己也說，這種新思路甚至在達爾文時期就已經初現端倪了，什么思路呢?那就是，我們只不過是基因制造出來的保護殼而已，世間的生物只不過是各種不同形式的保護殼，大家存在的目的只有一個，就是幫助基因繁衍下去。
說得更簡單一點兒，作者認為，咱們其實就是一輛坦克，而駕駛員就是基因。
不太好接受是吧?沒關系，如作者所說，這只是一種思路而已，當然他覺得這種思路更加符合事實。
暫且接受這個觀點，看由此出發能推導出什么結論。
首先，這個理論肯定了人類在生物界的特殊性。因為人類之前的進化，全是依靠基因的突變，這種方式漫長而無效率，而人類產生之后，人類就可以利用雜交等技術使得進化變得有方向性了，而更進一步，人類可以改變基因，創造出任何生物。
這個結論聽上去有倫理問題，而且也很可怕呵呵，沒關系，后面的結論大多是比較有意思的。
基因的壽命無限長，而它的載體卻沒必要很長。這是對生老病死的一種解釋，因為只要有繁殖，基因就可以把自己延續下去，而我們--基因的載體，只要完成了這個任務，那繼續活下去也就沒啥用了，所以當人完成了撫養未成年人的任務之后，就要面對死亡。
基因不會直接控制我們，而是生產出我們之后聽之任之，就像程序員與電子游戲，程序員編出來游戲后就不做什么大的修改了，只要把它放到市場上就好，成功的游戲留在市場上賣錢。
一個社會的領導者總是少的，群眾總是多的，厲害的人總是少的，受欺負的總是多的，因為基因博弈論證明，少數鷹派和多數鴿派是種群的最佳搭配方式。